La seconde et la troisième épîtres sont deux courts billets, émanant de la même main et au surplus étroitement apparentés à la première lettre. Ils n'ont été acceptés dans l'Église ancienne qu'après quelques hésitations, dues peut-être à leur peu d'importance. L'auteur y prend le titre d'Ancien, sans nom propre. On sait que Papias (Voir Introduction à l'Évangile de saint Jean) réservait cette appellation aux apôtres et aux disciples, témoins de la vie du Seigneur ; elle convenait excellemment à Jean, dernier survivant du groupe des Douze ; c'était une désignation discrète, mais suffisamment claire, comparable à celle de disciple aimé de Jésus pour le quatrième Évangile. Il est probable que ces lettres, si brèves et si peu doctrinales, n'auraient pas été conservées si elles n'avaient pas été d'origine apostolique. Elles ont dû être écrites à peu de chose près, en même temps que la première. La seconde est adressée à une « Dame élue », c'est-à-dire à une Église, impossible d'ailleurs à identifier, pour l'encourager dans la pratique de la charité et l'inviter à rompre avec les hérétiques. Dans la troisième, l'apôtre demande à un chrétien notable, du nom de Gaius, de faciliter la tâche des prédicateurs itinérants envoyés dans diverses églises et que l'évêque du lieu, Diotréphès, refuse de recevoir.